数月后，李元修被费英东引荐至努尔哈赤帐下，担任通商事务助理。努尔哈赤虽对朝廷心存戒备，然亦知辽东商贾乃获取物资之重要途径，故对李元修等人并未过多疑虑。李元修借此机会，暗中观察建州军情，探听努尔哈赤动向，并将所获情报密写于羊皮之上，藏于商队所携货物中，由赵守义暗中送回辽东。

与此同时，努尔哈赤亦在暗中部署兵力，命其子皇太极、多尔衮等人率军操练，并与科尔沁、察哈尔等蒙古部落再次联络，意图卷土重来。李元修察觉此事后，立即命人将情报密报朝廷，并设法拖延建州备战之期。他以商贾身份，频繁出入军营，借机散布辽东已加强边防、朝廷将遣使议和等消息，使努尔哈赤误判局势，暂缓出兵计划。

延熙七十八年春，朝廷接获李元修所报情报，朱允?立即召集顾明远、王敬之与李仲良议事。朱允?面色凝重，道：“朕已知努尔哈赤欲再起兵戈，意图联合蒙古诸部，共抗朝廷。此番若不早作应对，恐辽东再起边患。”顾明远奏道：“陛下，臣以为，可命辽东卫所加强防御，并遣使前往蒙古诸部，劝其勿与努尔哈赤合流。若能分化其势，朝廷便可稳住辽东局势。”王敬之道：“臣愿再赴蒙古，劝其与朝廷修好。”朱允?点头道：“此策可行。朕命你即刻启程，务必劝服蒙古诸部。”

王敬之领命而去，辽东卫所亦加强边防，命斥候深入女真诸部，监视其动向。李仲良则整顿辽东防务，命各卫所将领加强巡逻，并于要道设伏，以防建州突袭。

延熙七十八年夏，王敬之抵达蒙古科尔沁部，见其首领奥巴。奥巴虽与努尔哈赤有姻亲之亲，然亦知朝廷实力强盛，不愿轻易卷入战事。王敬之晓以利害，言道：“大明乃天朝上国，兵强马壮，粮草充足。若贵部与建州合流，朝廷必遣大军征讨，届时贵部亦将遭殃。若贵部愿与朝廷修好，朝廷愿以丝绸、茶叶、铁器相赠，并许以通商之利。”奥巴沉思良久，终答应与朝廷修好，并遣使入京，以表诚意。

与此同时，努尔哈赤亦察觉朝廷对其戒备，遂命其部族将领提前举兵，袭击辽东。然辽东卫所早有准备，于边境设伏，击退建州之兵。努尔哈赤见朝廷早有防备，遂退兵建州，然其野心已昭然若揭。

延熙七十九年春，朱允?于乾清宫召见赵文渊与林承泽，嘉奖辅臣书院之功。朱允?道：“朕知，朝廷能稳住辽东局势，皆赖辅臣书院之功。赵卿与林卿，皆为寒门辅臣，辅佐朝廷，奠定大明百年基业。”赵文渊与林承泽皆拱手谢恩。赵文渊道：“陛下，臣等不过尽己之力，辅佐朝廷。然辽东局势仍不可轻视，若朝廷欲彻底平定辽东，还需继续派遣学子深入女真诸部，以分化其势。”林承泽亦道：“陛下，臣以为，辅臣书院应继续设立辽东边务科，并增设军事战略课程，以培养更多边疆治理之才。”朱允?点头：“此策可行。朕命辅臣书院增设军事战略课程，并命赵卿与林卿继续主持书院事务。”