书院诸生日夜不息，历时月余，终成《书院志》一书，共十卷，详述书院设立之由、教化之实、义学之义、讲会之法、诸生之志，皆为书院之精神所在。

书院遂遣使者，将《书院志》呈于巡抚府，请其转呈朝廷，以明书院之志。

巡抚览书，面色微动，遂将《书院志》呈于京师，附言道：“书院设义学，广收寒门子弟，皆为忠义仁义之教，非为结党营私之意。诸生皆勤于学，更笃于志，书院之志，仍为天下寒门子弟之志。”

天子览书，面色稍缓，遂命礼部再赐书院匾额，题曰“寒门书院”，以彰其志。

书院再得赐匾，江南士绅皆惊，书院诸生亦皆大喜，齐声道：“书院之志，终将不灭！”

年长先生亲率诸生，于讲堂之中，高悬“寒门书院”匾额，命诸生谨记书院之志，非为功名利禄，乃为天下寒门子弟之志。

书院自此，更加注重寒门之志，诸生皆知书院之志，非为一己之私，乃为天下寒门子弟之志。书院之中，书声琅琅，灯火不息，学子日以继夜，苦读不辍。

年长先生常言：“书院之志，非为功名利禄，乃为天下寒门子弟之志。若书院能教出一代代寒门子弟，书院之精神，亦将不灭。”

诸生皆感其言，遂更勤于学，更笃于志。书院之志，终将不灭。寒门子弟的未来，终将光明。

然书院之盛，虽得朝廷嘉许，却亦引来新的风波。

沈仲文之侄沈伯元，素怀不甘，见书院屡遭构陷而未倒，遂另生一计，密遣心腹，往京师，贿赂御史，诬告书院私藏禁书、妄议朝政、图谋不轨。

御史得贿，遂上奏天子，言书院私藏禁书，妄议朝政，图谋不轨，恐为大患。

天子震怒，遂命锦衣卫再往江南书院，严查书院之实，并命其密探于书院内外布控，务必查明书院是否藏有异书、异心。

锦衣卫一行九人，皆为高手，乔装为书商、药商、布商、木匠等，悄然入江南，直奔书院。书院诸生皆未觉异样，惟年长先生察其行止，知其来意不善，遂召朱承志、林远、李文昭三人，密议应对之策。

年长先生道：“书院屡遭构陷，皆因书院之志与士绅之利相悖。今锦衣卫再至，恐有搜查之举，书院须早作准备。”

朱承志道：“书院所藏之书，皆为经史子集，无一禁书。若锦衣卫搜查，书院亦无所惧。”