然而，宇智波的覆灭并非一朝一夕之事。它像是一连串被精心布置的多米诺骨牌，而第一块骨牌倒下的时刻。

是在鸣人出生的那个晚上。

九尾之乱。

宇智波带土袭击木叶，放出九尾，导致鸣人的母亲漩涡玖辛奈牺牲。而父亲波风水门，为了不让木叶的“核武器”泄露，履行了火影的职责，将一半的九尾封印在了刚出生的鸣人体内……但宇智波灭族的重点不在这里。

真正让宇智波一族走向绝路的，是九尾眼中那双巨大的写轮眼。

当晚所有参战的木叶忍者都看得清清楚楚，高层怀疑是宇智波策划了这场袭击，并非毫无道理。

但是……他们还真没冤枉宇智波。

只是谁也没想到，那个操控九尾的宇智波，会是“已死”多年的宇智波带土。

木叶高层为了防范宇智波一族，将他们整体迁至村子的边缘地带，并实施严密的监视。高傲的宇智波族人无法忍受这种屈辱的对待。

在权力的欲望下，宇智波一族内部逐渐分裂。族会上，鹰派的声音越来越响亮，他们主张以武力夺取木叶政权，改变一族的处境。

此时，二五仔出现了。

宇智波鼬，族长富岳的长子，同时也是木叶安插在宇智波的间谍。他将族内企图政变的消息，全部透露给了木叶高层。

得知此事后，三代目火影与团藏产生了分歧。三代主张和谈，希望通过沟通化解矛盾，而团藏则坚持要根除隐患，彻底消灭宇智波的威胁。

之后，团藏开始了他的行动。

他忌惮宇智波止水的万花筒写轮眼，那能够改写意志的“别天神”。在一次隐秘的偷袭中，团藏夺走了止水的一只眼睛。